HTH

HTH یا مارپیچ-پیچ-مارپیچ (انگلیسی: Helix-turn-helix) یک موتیف ساختاری مهم در پروتئین‌هاست که قادر است به دی‌ان‌ای اتصال یابد.

پروتئین تنظیم‌کننده HTH در باکتری، خانوادهٔ lysR
شناسه‌ها
نمادHTH_1
پی‌فمPF00126
پی‌فم clanCL0123
اینترپروIPR000847
PROSITEPDOC00043
SCOPe1al3 / SUPFAM
سرکوب‌گر λ در باکترویفاژ لامبدا از یک موتیف HTH (سمت چپ؛ سبز) برای اتصال به دی‌ان‌ای (سمت‌راست: آبی و قرمز) استفاده می‌کند.

این موتیف از دو مارپیچ آلفا تشکیل شده که توسط رشتهٔ کوتاهی از اسیدهای آمینه به هم متصل شده‌اند و در بسیاری از پروتئین‌هایی که در تنظیم بیان ژن دخالت دارند، دیده می‌شود. این موتیف را نباید با موتیف دیگری به نام HLH اشتباه گرفت.[1]

این موتیف‌ها بر اساس ساختار و نحوهٔ قرارگیری فضاییِ مارپیچِ حلزونی‌شکل‌شان به چند زیرگروه تقسیم می‌شوند:[2][3][4]

  • دو حلقه‌ای
  • سه حلقه‌ای
  • چهار حلقه‌ای
  • بالدار
  • متفرقه

جستارهای وابسته

منابع

  1. Brennan RG, Matthews BW (1989). "The helix-turn-helix DNA binding motif". J Biol Chem. 264 (4): 1903–6. PMID 2644244.
  2. Wintjens R, Rooman M (1996). "Structural classification of HTH DNA-binding domains and protein-DNA interaction modes". J Mol Biol. 262 (2): 294–313. doi:10.1006/jmbi.1996.0514. PMID 8831795.
  3. Suzuki M, Brenner SE (1995). "Classification of multi-helical DNA-binding domains and application to predict the DBD structures of sigma factor, LysR, OmpR/PhoB, CENP-B, Rapl, and Xy1S/Ada/AraC". FEBS Lett. 372 (2–3): 215–21. doi:10.1016/0014-5793(95)00988-L. PMID 7556672.
  4. Aravind L, Anantharaman V, Balaji S, Babu MM, Iyer LM (2005). "The many faces of the helix-turn-helix domain: transcription regulation and beyond". FEMS Microbiol Rev. 29 (2): 231–62. doi:10.1016/j.femsre.2004.12.008. PMID 15808743.

بیشتر بخوانید

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.