لکتین نوع سی
لکتین نوع سی (انگلیسی: C-type lectin) با نام اختصاری CLEC یک دومین پروتئین متصلشونده به کربوهیدرات موسوم به لکتین است.[3] حرفِ «سی» در این نامگذاری، به وابستگی این مولکول به کلسیم جهت چسبندگیاش اشاره دارد.[4] پروتئینهایی که حاوی این دومین هستند، عملکرد مختلفی دارند که از میان آنها میتوان به چسبندگی سلول-سلول، پاسخ دستگاه ایمنی به میکروبهای بیماریزا و خزان یاختهای اشاره کرد.[5][6]
دومین لکتین نوع سی | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
شناسهها | |||||||||
نماد | Lectin_C | ||||||||
پیفم | PF00059 | ||||||||
اینترپرو | IPR001304 | ||||||||
SMART | CLECT | ||||||||
PROSITE | PS50041 | ||||||||
SCOPe | 2msb / SUPFAM | ||||||||
سیدیدی | cd00037 | ||||||||
Membranome | 52 | ||||||||
|
طبقهبندی
دریکامر و همکاران، لکتینهای نوع سی را بر حسب دومین موجود در هر پروتئین به ۷ زیرگروه تقسیم کردند.[7] این طبقهبندی در سال ۲۰۰۲ میلادی بهروزرسانی شد و ۷ زیرگروه دیگر بدان افزوده شد. (زیرگروه ۸ تا ۱۴)[8] اخیراً سه زیرگروه دیگر هم اضافه شده و کلاً به ۱۷ زیرگروه رسیدهاست. (۱۵ تا ۱۷)[3]
گروه | نام | دومینهای وابسته |
---|---|---|
۱ | لکتینها | دومینهای فاکتور رشد اپیدرمی، دومین سوشی ۲، دومینهای اتصالی و ایمونوگلوبولینی |
۲ | آسیالوگلیکوپروتئین و گیرندههای سلولهای دندریتیک | ندارد |
۳ | کالکتینها | ندارد |
۴ | سلکتینها | دومین سوشی ۲ و دومینهای فاکتور رشد اپیدرمی |
۵ | گیرندهٔ سلول کشنده طبیعی | ندارد |
۶ | گیرندههای درونسلولی شبه لکتین نوع سی چندتایی | دومینهای رایسین و فیبرونکتین نوع ۲ |
۷ | خانوادهٔ پروتئینهای بازسازیکننده | ندارد |
۸ | کوندرولکتین، لائیلین | ندارد |
۹ | تترانکتین | ندارد |
۱۰ | پلیسیستین ۱ | دومینهای WSC ، REJ و PKD |
۱۱ | اترکتین | دومینهای پیاسآی، دومین فاکتور رشد اپیدرمی و دومین کاب |
۱۲ | پروتئین بازی اصلی ائوزینوفیل (EMBP) | ندارد |
۱۳ | DGCR2 | ندارد |
۱۴ | ترومبومودولین، CD93، CD248 و CLEC14A | دومینهای فاکتور رشد اپیدرمی[9] |
۱۵ | بایمْـلِـک | ندارد |
۱۶ | SEEC | دومینهای پروتئین حملکننده استرول (SCP) و فاکتور رشد اپیدرمی |
۱۷ | CBCP/FREM1/QBRICK | دومینهای توالی CSPG و موتیف کالکس-بتا |
موارد زیر نیز جزء «لکتینهای نوع سی» (CLECs) هستند:
- CLEC1A، CLEC1B
- CLEC2A، CLEC2B، CD69 (CLEC2C)، CLEC2D، CLEC2L
- CLEC3A، CLEC3B
- CLEC4A، CLEC4C، CLEC4D، CLEC4E، CLEC4F، CLEC4G، گیرنده ۱ آسیالوگلیکوپروتئین (CLEC4H1)، گیرنده ۲ آسیالوگلیکوپروتئین (CLEC4H2)، CD23 (CLEC4J)، لانگرین (پروتئین) (CLEC4K)، DC-SIGN (CLEC4L)، CLEC4M
- CLEC5A
- CLEC6A
- CLEC7A
- OLR1 (CLEC8A)
- CLEC9A
- CLEC10A
- CLEC11A
- CLEC12A، CLEC12B
- CD302 (CLEC13A)، LY75 (CLEC13B)، PLA2R1 (CLEC13C)، MRC1 (CLEC13D)، MRC2 (CLEC13E)
- CLEC14A
- CLEC16A
- CLEC17A
گیرندههای شبهلکتینی سلولهای طبیعی کشنده گروهی از پروتئینها هستند که شباهت فراوانی به لکتینهای نوع سی دارند:[10]
- KLRA1
- KLRB1 (CLEC5B)
- KLRC1 ،KLRC2 ،KLRC3 ،KLRC4
- KLRD1
- KLRF1 (CLEC5C)
- KLRG1 (CLEC15A)، KLRG2 (CLEC15B)
- KLRK1
پروتئینهای دیگری که حاوی این دومِـین هستند:
- AGC1؛ ATRNL1
- BCAN
- CD248؛ CD72؛ CD93؛ CHODL؛ CL-K1-Ia؛ CL-K1-Ib؛ CL-K1-Ic؛ CLECSF5؛ COLEC10؛ COLEC11؛ COLEC12؛ CSPG3
- FCER2؛ FREM1؛ HBXBP
- LAYN؛ LOC348174؛ LOC728276
- MAFA؛ MBL2؛ MGC34761؛ MICL؛ MRC1L1
- OLR1
- PAP؛ PKD1؛ PKD1L2؛ PLA2R1؛ PRG2؛ PRG3
- REG1A؛ REG1B؛ REG3A؛ REG3G؛ REG4
- SELE؛ SELL؛ SELP؛ SFTPA1؛ SFTPA2؛ SFTPA2B؛ SFTPD؛ SRCL
- THBD
- VCAN
منابع
- Walker JR, Nagar B, Young NM, Hirama T, Rini JM (April 2004). "X-ray crystal structure of a galactose-specific C-type lectin possessing a novel decameric quaternary structure". Biochemistry. 43 (13): 3783–92. doi:10.1021/bi035871a. PMID 15049685.
- Mahla RS, Reddy MC, Prasad DV, Kumar H (September 2013). "Sweeten PAMPs: Role of Sugar Complexed PAMPs in Innate Immunity and Vaccine Biology". Frontiers in Immunology. 4: 248. doi:10.3389/fimmu.2013.00248. PMC 3759294. PMID 24032031.
- Zelensky AN, Gready JE (December 2005). "The C-type lectin-like domain superfamily". FEBS J. 272 (24): 6179–217. doi:10.1111/j.1742-4658.2005.05031.x. PMID 16336259.
- C-Type Lectin در سرعنوانهای موضوعی پزشکی (MeSH) در کتابخانهٔ ملی پزشکی ایالات متحدهٔ آمریکا
- Drickamer K (October 1999). "C-type lectin-like domains". Curr. Opin. Struct. Biol. 9 (5): 585–90. doi:10.1016/S0959-440X(99)00009-3. PMID 10508765.
- Cambi A, Figdor C (May 2009). "Necrosis: C-type lectins sense cell death". Curr. Biol. 19 (9): R375–8. doi:10.1016/j.cub.2009.03.032. PMID 19439262.
- Drickamer K (1993). "Evolution of Ca(2+)-dependent animal lectins". Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. Progress in Nucleic Acid Research and Molecular Biology. 45: 207–32. doi:10.1016/S0079-6603(08)60870-3. ISBN 978-0-12-540045-9. PMID 8341801.
- Drickamer K, Fadden AJ (2002). "Genomic analysis of C-type lectins". Biochem. Soc. Symp. (69): 59–72. PMID 12655774.
- "C-type lectin domain group 14 proteins in vascular biology, cancer and inflammation". FEBS Journal. PMID 31287944.
- NK Cell Lectin-Like Receptors در سرعنوانهای موضوعی پزشکی (MeSH) در کتابخانهٔ ملی پزشکی ایالات متحدهٔ آمریکا
- مشارکتکنندگان ویکیپدیا. «C-type lectin». در دانشنامهٔ ویکیپدیای انگلیسی، بازبینیشده در ۲۴ نوامبر ۲۰۱۹.
در ویکیانبار پروندههایی دربارهٔ لکتین نوع سی موجود است. |