ساختار اولیه پروتئین

ساختار اول پروتئین (به انگلیسی: Protein primary structure) عبارت از آرایش و توالی خطی آمینواسیدها در یک پروتئین یا پپتید است که از سر آمینی (N) تا کربوکسیلیک اسید انتهایی (C) ادامه دارد.[1] در ساختار اولیهٔ پروتئین، فقط شاهد پیوند پپتیدی و ترتیب قرارگیری آمینواسیدها هستیم. بیوسنتز پروتئین در سلول‌ها معمولاً توسط ریبوزوم انجام می‌گیرد اما تولید پپتیدها در آزمایشگاه نیز امکان‌پذیر است.[2]

توالی‌یابی آمینواسیدها در یک رشته پروتئین، هم به‌طور مستقیم و هم از طریق بررسی رشته دی‌ان‌ای ابتدایی قابل انجام است.[2]

نمادها و خلاصه‌نویسی

توالی‌های آمینو اسیدی معمولاً به‌صورت یک رشته از نمادهای سه‌حرفی یا تک‌حرفی نوشته شده در کنار هم، توصیف می‌شوند.[3]

نماد اختصاری ۲۰ آمینو اسید طبیعی
آمینو اسید نماد سه‌حرفی نماد یک‌حرفی
Alanine (آلانین) Ala A
Arginine (آرژینین) Arg R
Asparagine (آسپاراژین) Asn N
Aspartic acid

(اسید آسپارتیک)

Asp D
Cysteine (سیستئین) Cys C
Glutamic acid (گلوتامیک اسید) Glu E
Glutamine (گلوتامین) Gln Q
Glycine (گلایسین) Gly G
Histidine (هیستیدین) His H
Isoleucine (ایزولوسین) Ile I
Leucine (لوسین) Leu L
Lysine (لیزین) Lys K
Methionine (متیونین) Met M
Phenylalanine

(فنیل‌آلانین)

Phe F
Proline (پرولین) Pro P
Serine (سرین) Ser S
Threonine (ترئونین) Thr T
Tryptophan (تریپتوفان) Trp W
Tyrosine (تیروزین) Tyr Y
Valine (والین) Val V

منابع

  1. Sanger, F. (1952). "The arrangement of amino acids in proteins". Advances in Protein Chemistry. 7: 1–67. doi:10.1016/s0065-3233(08)60017-0. ISSN 0065-3233. PMID 14933251.
  2. Aasland, Rein; Abrams, Charles; Ampe, Christophe; Ball, Linda J.; Bedford, Mark T.; Cesareni, Gianni; Gimona, Mario; Hurley, James H.; Jarchau, Thomas (2002-02-20). "Normalization of nomenclature for peptide motifs as ligands of modular protein domains". FEBS letters. 513 (1): 141–144. doi:10.1016/s0014-5793(01)03295-1. ISSN 0014-5793. PMID 11911894.
  3. Aasland, Rein; Abrams, Charles; Ampe, Christophe; Ball, Linda J.; Bedford, Mark T.; Cesareni, Gianni; Gimona, Mario; Hurley, James H.; Jarchau, Thomas (2002-02-20). "Normalization of nomenclature for peptide motifs as ligands of modular protein domains". FEBS letters. 513 (1): 141–144. doi:10.1016/s0014-5793(01)03295-1. ISSN 0014-5793. PMID 11911894.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.