ژنوم انسان

ژنوم انسان، مجموعهٔ کاملی از توالی اسید نوکلئیک موجود در سلول‌های انسان است، که به صورت دی‌ان‌ای در ۲۳ جفت کروموزوم در هستهٔ سلول‌ها به همراه یک رشته دی ان ای کوچک به نام دی‌ان‌ای میتوکندریایی در میتوکندری سلول‌ها قرار دارند. ژنوم انسان شامل هر دو ژن دی‌ان‌ای کد کنندهٔ پروتئین و دی‌ان‌ایِ بی‌رمز است. دی‌ان‌ایِ هاپلوئید ژنوم انسان، که در داخل سلول‌های جنسی (تخمک و اسپرم) سلول‌ها در فاز میوز تولید مثل جنسی تولید شده‌اند، قبل از لقاح یک یاخته تخم) ایجاد می‌شوند، شامل سه میلیارد باز نوکلئوتیدی هستند، در حالی که ژنوم دیپلوئید (موجود در سلول‌های یاخته‌های پیکری)، یا جفت شده که دارای دو برابر محتوای دی‌ان‌ای است. در حالی که تفاوت‌های قابل توجهی در میان ژنوم افراد بشر (در حد ۰٫۱٪) وجود دارد،[1] این تفاوت‌ها به صورت قابل توجهی تفاوت‌های کوچک‌تری نسبت به تفاوت‌های بین انسان‌ها و نزدیک‌ترین خویشاوندان زنده آن‌ها، شامپانزه (حدود ۴٪)[2] و بونوبوهاست.

Genomic information
تصویر شماتیک کاریوتایپ، انسان که شامل ۴۶ کروموزوم در حالت دیپلوئید است. در این تصویر هر دو کروموزوم جنسی مذکر و مؤنث به نمایش گذاشته شده و از نمایش دی ان ای میتوکندری صرف نظر شده‌است. خط‌های افقی در تصویر نشان دهندهٔ محل سانترومر کروموزوم‌ها هستند.
مرکز ملی اطلاعات زیست‌فناوری genome ID۵۱
پلوئیدیدیپلوئید
Genome size۳٫۱ میلیارد جفت باز معادل ۶٫۲ میلیارد باز در حالت دیپلوئید.
Number of کروموزومs۲۳ جفت

پروژه ژنوم انسان نخستین توالی کامل ژنوم انسانی منحصر به تک‌نفر را، با نخستین پیش‌نویس توالی و تجزیه و تحلیل اولیه تولید کرد که در ۱۲ فوریه ۲۰۰۱ منتشر شد.[3] ژنوم انسان نخستین مورد در میان همهٔ مهره‌داران بود که به‌طور کامل و سرتاسری تعیین توالی شد. از سال ۲۰۱۲، هزاران ژنوم انسان به‌طور کامل توالی یابی شدند، و بسیاری دیگر نیز با تفکیک‌پذیری‌های پایین‌تر در وضوح، نقشه‌برداری شدند. اطلاعات به دست‌آمده، در سراسر جهان در علوم زیست‌پزشکی، انسان‌شناسی زیستی، پزشکی قانونی و سایر شاخه‌های علوم مورد استفاده قرار دارد. با داشتن این اطلاعات امیدهایی به وجود آمده که مطالعات ژنومی خواهد توانست به پیشرفت در تشخیص و درمان بیماری‌ها، و به بینش‌های تازه در بسیاری از زمینه‌های زیست‌شناسی، از جمله فرگشت انسان منجر شود.

هرچند که امروز توالی ژنوم انسان به‌طور کامل توسط توالی دی‌ان‌اِی تعیین شده، اما همچنان عملکرد بسیاری از بخش‌های توالی و ژن‌ها ناشناخته است. بیشتر ژن‌ها با ترکیبی از روش‌های تجربی و بیوانفورماتیکی شناسایی شده‌اند، با این حال هنوز بررسی‌ها و مطالعات زیادی برای روشن‌سازی عملکردهای بیولوژیک و فراورده‌های پروتئین و آران‌اِی باید انجام شود. نتیجه‌های تازه به دست‌آمده نشان می‌دهند که مقدار زیادی از توالی‌های بی‌رمز در ژنوم انسان با مواردی چون فرایندهای بیوشیمیایی، از جمله ساماندهی بیان ژن، معماری کروموزوم یا سیگنال‌های کنترل اپی ژنتیک مرتبط هستند.

آرایش مولکولی و محتوای ژن

ژنوم انسان به صورت ۲۲ جفت کروموزوم، به علاوهٔ کروموزوم X (یکی در مردان و دو عدد در زنان)، و تنها در مردان یک کروموزوم Y، سازمان‌دهی شده‌است. این‌ها همه مولکول‌های خطی بزرگ دی‌ان‌ای موجود در هستهٔ سلول‌ها هستند. ژنوم همچنین شامل دی‌ان‌ای میتوکندریایی است، که مولکول حلقوی به نسبت کوچکی در هر میتوکندری است. اطلاعات ابتدایی دربارهٔ این مولکول‌ها و محتوای ژنی آن، بر اساس یک پایگاه داده‌های مرجع ژنوم است که توالی مربوط به فرد خاصی را نشان نمی‌دهد، در جدول زیر ارائه شده‌است.[4] ==

کروموزومطول (میلی‌متر)جفت‌بازدگرگونی‌هاپروتئین‌های تأییدیپروتئین‌های قلمدادیشبه‌ژن‌هاmiRNArRNAsnRNAsnoRNAMisc ncRNALinksCentromere position (Mbp)Cumulative (%)
کروموزوم ۱ (انسان)۸۵۲۴۹٬۲۵۰٬۶۲۱۴٬۴۰۱٬۰۹۱۲٬۰۱۲۳۱۱٬۱۳۰۱۳۴۶۶۲۲۱۱۴۵۱۰۶EBI۱۲۵٫۰۷٫۹
کروموزوم ۲ (انسان)۸۳۲۴۳٬۱۹۹٬۳۷۳۴٬۶۰۷٬۷۰۲۱٬۲۰۳۵۰۹۴۸۱۱۵۴۰۱۶۱۱۱۷۹۳EBI۹۳٫۳۱۶٫۲
کروموزوم ۳ (انسان)۶۷۱۹۸٬۰۲۲٬۴۳۰۳٬۸۹۴٬۳۴۵۱٬۰۴۰۲۵۷۱۹۹۹۲۹۱۳۸۸۷۷۷EBI۹۱٫۰۲۳٫۰
کروموزوم ۴ (انسان)۶۵۱۹۱٬۱۵۴٬۲۷۶۳٬۶۷۳٬۸۹۲۷۱۸۳۹۶۹۸۹۲۲۴۱۲۰۵۶۷۱EBI۵۰٫۴۲۹٫۶
کروموزوم ۵ (انسان)۶۲۱۸۰٬۹۱۵٬۲۶۰۳٬۴۳۶٬۶۶۷۸۴۹۲۴۶۷۶۸۳۲۵۱۰۶۶۱۶۸EBI۴۸٫۴۳۵٫۸
کروموزوم ۶ (انسان)۵۸۱۷۱٬۱۱۵٬۰۶۷۳٬۳۶۰٬۸۹۰۱٬۰۰۲۳۹۷۳۱۸۱۲۶۱۱۱۷۳۶۷ بEBI۶۱٫۰۴۱٫۶
کروموزوم ۷ (انسان)۵۴۱۵۹٬۱۳۸٬۶۶۳۳٬۰۴۵٬۹۹۲۸۶۶۳۴۸۰۳۹۰۲۴۹۰۷۶۷۰EBI۵۹٫۹۴۷٫۱
کروموزوم ۸ (انسان)۵۰۱۴۶٬۳۶۴٬۰۲۲۲٬۸۹۰٬۶۹۲۶۵۹۳۹۵۶۸۸۰۲۸۸۶۵۲۴۲EBI۴۵٫۶۵۲٫۰
کروموزوم ۹ (انسان)۴۸۱۴۱٬۲۱۳٬۴۳۱۲٬۵۸۱٬۸۲۷۷۸۵۱۵۷۱۴۶۹۱۹۶۶۵۱۵۵EBI۴۹٫۰۵۶٫۳
کروموزوم ۱۰ (انسان)۴۶۱۳۵٬۵۳۴٬۷۴۷۲٬۶۰۹٬۸۰۲۷۴۵۱۸۵۰۰۶۴۳۲۸۷۵۶۵۶ آEBI۴۰٫۲۶۰٫۹
کروموزوم ۱۱ (انسان)۴۶۱۳۵٬۰۰۶٬۵۱۶۲٬۶۰۷٬۲۵۴۱٬۲۵۸۴۸۷۷۵۶۳۲۴۷۴۷۶۵۳EBI۵۳٫۷۶۵٫۴
کروموزوم ۱۲ (انسان)۴۵۱۳۳٬۸۵۱٬۸۹۵۲٬۴۸۲٬۱۹۴۱٬۰۰۳۴۷۵۸۲۷۲۲۷آ۱۰۶۶۲۶۹بEBI۳۵٫۸۷۰٫۰
کروموزوم ۱۳ (انسان)۳۹۱۱۵٬۱۶۹٬۸۷۸۱٬۸۱۴٬۲۴۲۳۱۸۸۳۲۳۴۲۱۶۴۵۳۴۳۶EBI۱۷٫۹۷۳٫۴
کروموزوم ۱۴ (انسان)۳۶۱۰۷٬۳۴۹٬۵۴۰۱٬۷۱۲٬۷۹۹۶۰۱۵۰۴۷۲۹۲۱۰۶۵۹۷۴۶EBI۱۷٫۶۷۶٫۴
کروموزوم ۱۵ (انسان)۳۵۱۰۲٬۵۳۱٬۳۹۲۱٬۵۷۷٬۳۴۶۵۶۲۴۳۴۷۳۷۸۱۳۶۳۱۳۶۳۹EBI۱۹٫۰۷۹٫۳
کروموزوم ۱۶ (انسان)۳۱۹۰٬۳۵۴٬۷۵۳۱٬۷۴۷٬۱۳۶۸۰۵۶۵۴۲۹۵۲۳۲۵۳۵۸۳۴EBI۳۶٫۶۸۲٫۰
کروموزوم ۱۷ (انسان)۲۸۸۱٬۱۹۵٬۲۱۰۱٬۴۹۱٬۸۴۱۱٬۱۵۸۴۴۳۰۰۶۱۱۵۸۰۷۱۴۶EBI۲۴٫۰۸۴٫۸
کروموزوم ۱۸ (انسان)۲۷۷۸٬۰۷۷٬۲۴۸۱٬۴۴۸٬۶۰۲۲۶۸۲۰۵۹۳۲۱۳۵۱۳۶۲۵EBI۱۷٫۲۸۷٫۴
کروموزوم ۱۹ (انسان)۲۰۵۹٬۱۲۸٬۹۸۳۱٬۱۷۱٬۳۵۶۱٬۳۹۹۲۶۱۸۱۱۱۰۱۳۲۹۳۱۱۵EBI۲۶٫۵۸۹٫۳
کروموزوم ۲۰ (انسان)۲۱۶۳٬۰۲۵٬۵۲۰۱٬۲۰۶٬۷۵۳۵۳۳۱۳۲۱۳۵۷۱۵۴۶۳۷۳۴EBI۲۷٫۵۹۱٫۴
کروموزوم ۲۱ (انسان)۱۶۴۸٬۱۲۹٬۸۹۵۷۸۷٬۷۸۴۲۲۵۸۱۵۰۱۶۵۲۱۱۹۸EBI۱۳٫۲۹۲٫۶
کروموزوم ۲۲ (انسان)۱۷۵۱٬۳۰۴٬۵۶۶۷۴۵٬۷۷۸۴۳۱۲۱۳۰۸۳۱۵۲۳۲۳۲۳EBI۱۴٫۷۹۳٫۸
کروموزوم ایکس۵۳۱۵۵٬۲۷۰٬۵۶۰۲٬۱۷۴٬۹۵۲۸۱۵۲۳۷۸۰۱۲۸۲۲۸۵۶۴۵۲EBI۶۰٫۶۹۹٫۱
Y۲۰۵۹٬۳۷۳٬۵۶۶۲۸۶٬۸۱۲۴۵۸۳۲۷۱۵۷۱۷۳۲EBI۱۲٫۵۱۰۰٫۰
ام‌تی دی‌ان‌ای۰٫۰۰۵۴۱۶٬۵۶۹۹۲۹۱۳۰۰۰۲۰۰۲۲EBIN/A۱۰۰٫۰
مجموع بیش از ۳ بیلیون۳٬۰۹۵٬۶۹۳٬۹۸۱۱۹٬۳۱۳۷۳۸۱۲٬۸۵۹

جدول ۱ (بالا) سازمان‌یافتگی فیزیکی و محتوای ژنی ژنوم مرجع انسان را خلاصه می‌کند. این چکیده با پیوندهایی به تجزیه و تحلیل اصلی؛ همان‌گونه که در پایگاه داده‌های (Ensembl) در مؤسسه اروپایی بیوانفورماتیک (ای‌بی‌آی EMBL-EBI) و مؤسسهٔ (ولکام تراست سانگر) منتشر شده٫ کوتاه‌نویسی شده‌است. طول کروموزوم را با ضرب کردن شمار جفت‌های باز (جفت بازها) در ۰۰٫۳۴ نانومتر؛ که برآورد شدهٔ فاصله بین جفت بازها در دی‌ان‌ای دو رشته‌ای است، محاسبه می‌کنند. تعداد پروتئین‌ها بر پایهٔ رونوشت اولیهٔ ژن پیشرو (mRNA ام‌آران‌ای) است، و شامل پیرایش جایگزین قبل از (mRNA ام‌آران‌ای)، یا تغییراتی که در ساختار پروتئینی پس از ترجمه رخ داده، نمی‌شود.

دی‌ان‌ای کد کننده در برابر دی‌ان‌ایِ بی‌رمز

محتوای ژنوم انسان معمولاً به توالی دی‌ان‌ایِ کد کننده یا رمزگذار و غیررمزگذار یا غیر کد کننده تقسیم شده‌است. توالی دی‌ان‌ایِ کد کننده به آن بخش از توالی‌ها گفته می‌شود که می‌توانند به آران‌ای پیام‌رسان (mRNA) رونویسی و در ادامه به پروتئین‌ها ترجمه شوند. این توالی‌ها تنها بخش کوچکی از ژنوم (<۲٪) را اشغال می‌کنند. دی‌ان‌ای‌های غیر کدکننده یا بی‌رمز توالی هایب هستند که حدود ۹۸ درصد دیگر ژنوم را پر کرده‌اند و از آن‌ها برای رمزگذاری و نهایتاً تولید پروتئین استفاده نمی‌شود.

برخی از دی‌ان‌ای‌های بی‌رمز محتوی مولکول‌های آران‌اِی با کاربردهای مهم بیولوژیکی مانند آران‌ای ریبوزومی و آران‌ای حامل هستند. پیدا کردن عملکرد و منشأ فرگشتی دی‌ان‌ای‌های بی‌رمز یک هدف مهم از بررسی‌های ژنوم است که شامل پروژهٔ رمزگذاری ان‌کد (دانشنامهٔ اجزای دی‌ان‌اِی) می‌باشد که هدف آن بررسی همهٔ ژنوم انسان، با استفاده از ابزارهای تجربی گوناگون است که پاسخ‌های به دست‌آمده از آن‌ها نشان‌گر چگونگی فعالیت مولکولی است. با توجه به اینکه یاخته برای رونویسی دی‌ان‌ای بی‌رمز انرژی زیادی مصرف می‌کند، این سؤال پیش می‌آید که نقش زیستی این اجزا چیست؟ به نظر می‌رسد یکی از نقش‌های این اجزا، تنظیم رونویسی است. با افزایش تعداد و اندازه دی‌ان‌ای بی‌رمز رونویسی از ژن‌ها بیشتر طول می‌کشد و در نتیجه محصول کمتری تولید می‌شود. نقش دیگر این توالی‌ها، ایجاد تنوع در محصول است که نتیجه پیرایش متفاوت رنای پیک است. با اینکه در بعضی ژن‌ها چسبیدن رونوشت‌های یک ژن، به‌طور منظم و یکنواخت انجام می‌شود، در بعضی ژن‌ها، چسبیدن رونوشت‌ها به صورت تصادفی انجام می‌شود. نقش دیگری که برای این دناهای بی‌رمز در نظر می‌گیرند، کاهش آسیب‌های مؤثر به دِنا است زیرا برخی آسیب‌ها ممکن است در محل دناهای بی‌رمز رخ دهند که با حذف آنها، آسیب‌ها اثری نخواهد داشت. از آنجا که دی‌ان‌ای‌های بی‌رمز از کد کننده‌ها بسیار بیشترند، مفهوم توالی ژنوم بیشتر به یک مفهوم تحلیلی متمرکز شده تا از مفهوم کلاسیک «ژن برنامه‌نویسی دی‌ان‌ای».[5][6]

بیماری‌های ژنتیکی بشر
نوشتار اصلی: اختلال ژنتیکی

بسیاری از جنبه‌های زیست‌شناسی انسان شامل هر دو عامل ژنتیکی (ارثی)، و غیر ژنتیکی (محیط زیستی)، می‌شود. برخی از تفاوت‌های مؤثر ما موروثی هستند مانند (قامت، رنگ چشم، توانایی چشایی یک طعم یا یک بوی ویژه، و غیره) و در ذات خود بیماری نیستند و ریشهٔ زیست‌شناسی دارند. علاوه بر این، برخی دیگر از تفاوت‌های ژنتیکی تنها در ترکیب با عوامل محیطی مناسب (مانند رژیم غذایی) باعث بیماری می‌شوند. از این نگاه و نیاز به این هشدارها، این اختلالات ژنتیکی ممکن است به عنوان بیماری بالینی تعریف شوند که ناشی از تنوع ژنومی توالی دی‌ان‌اِی است. در موارد ساده‌تر، این اختلال می‌تواند با تغییر در یک ژن منفرد در ارتباط باشد. به عنوان مثال، فیبروز سیستیک بر اثر جهش در ژن (CFTR سی‌اف‌تی‌آر) ایجاد می‌شود، و شایع‌ترین اختلال مغلوب در نژاد قفقازی با بیش از ۱۳۰۰ جهش مختلف شناخته شده‌است.[7]

جستارهای وابسته
  • مرجع ژنوم

منابع
  1. Abecasis GR, Auton A, Brooks LD, DePristo MA, Durbin RM, Handsaker RE, Kang HM, Marth GT, McVean GA (Nov 2012). "An integrated map of genetic variation from 1,092 human genomes". Nature. 491 (7422): 56–65. doi:10.1038/nature11632. PMC 3498066. PMID 23128226.
  2. Varki A, Altheide TK (Dec 2005). "Comparing the human and chimpanzee genomes: searching for needles in a haystack". Genome Research. 15 (12): 1746–58. doi:10.1101/gr.3737405. PMID 16339373.
  3. International Human Genome Sequencing Consortium Publishes Sequence and Analysis of the Human Genome
  4. http://jul2012.archive.ensembl.org/Homo_sapiens/Location/Chromosome?r=1:1-1000000. پارامتر |عنوان= یا |title= ناموجود یا خالی (کمک)
  5. Ken Waters (2007-03-07). "Molecular Genetics". Stanford Encyclopedia of Philosophy. Retrieved 2013-07-18.
  6. Lisa Gannett (2008-10-26). "The Human Genome Project". Stanford Encyclopedia of Philosophy. Retrieved 2013-07-18.
  7. Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.