پروتئین اتصالدهنده ایمونوگلوبولین
پروتئین اتصالدهنده ایمونوگلوبولین (BiP) که با نامهای GRP-78 یا پروتئین گرماشوک ۷۰ کیلو دالتونی ۵ (HSPA5) یا (Byun1) نیز شناخته میشود، پروتئینی است که در انسان توسط ژن HSPA5 رمزگذاری میشود.[4][5]
پروتئین اتصالدهنده ایمونوگلوبولین یک شپرون مولکولی Hsp70 است که در لومن شبکه آندوپلاسمی جای گرفته و پروتئینهای نوساخت را هنگام انتقال به شبکه آندوپلاسمی متصل میکند و آنها را در حالت مناسب برای تاشدگی و الیگومریزاسیون بعدی حفظ میکند. پروتئین اتصالدهنده ایمونوگلوبولین همچنین یک بخشی بنیادین در دستگاه جابجایی است که در جابهجایی رو به عقب پروتئینهای گمراه از طریق غشای شبکه آندوپلاسمی که برای تخریب توسط پروتئازوم مقصد هستند، نقش دارد. پروتئین اتصالدهنده ایمونوگلوبولین در هر شرایط رشد یک پروتئین فراوان است، اما ساخت آن تحت شرایطی که منجر به تجمع پلیپپتیدهای بازنشده در شبکه آندوپلاسمی شود، بهطور قابل توجهی القا میشود.
ساختار
پروتئین اتصالدهنده ایمونوگلوبولین شامل دو دامنه عملکردی است: دامنه اتصال نوکلئوتید (NBD) و دامنه اتصال پیشماده (SBD). دامنه اتصال نوکلئوتید به آدنوزین تریفسفات متصل شده و آن را هیدرولیز میکند و دامنه اتصال پیشماده به پلیپپتیدها متصل میشود.[6]
دامنه اتصال نوکلئوتید شامل دو زیردامنه بزرگ کروی (I و II) است که هر کدام بیشتر به دو زیردامنه کوچک (A و B) تقسیم میشوند. زیر دامنهها با شکافی جدا میشوند که در آن نوکلئوتید، یک یون Mg2 و دو یون +K هر چهار حوزه (IA , IB , IIA , IIB) را به هم متصل کرده و به هم پیوند میکنند.[7][8][9] دامنه اتصال پیشماده به دو زیر دامنه SBDβ و SBDα تقسیم میشود. SBDβ به عنوان یک جایگاه اتصال برای پروتئینهای مشتری یا پپتید و SBDα به عنوان یک درب مارپیچ برای پوشاندن جایگاه اتصال عمل میکند.[10][11][12] یک پیونددهنده میاندامنهای NBD و SBD را به هم متصل میکند و از ایجاد رابط NBD-SBD پشتیبانی میکند.[6]
منابع
- GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026864 - Ensembl, May 2017
- "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- Ting J, Lee AS (May 1988). "Human gene encoding the 78,000-dalton glucose-regulated protein and its pseudogene: structure, conservation, and regulation". DNA. 7 (4): 275–86. doi:10.1089/dna.1988.7.275. PMID 2840249.
- Hendershot LM, Valentine VA, Lee AS, Morris SW, Shapiro DN (Mar 1994). "Localization of the gene encoding human BiP/GRP78, the endoplasmic reticulum cognate of the HSP70 family, to chromosome 9q34". Genomics. 20 (2): 281–4. doi:10.1006/geno.1994.1166. PMID 8020977.
- Yang J, Nune M, Zong Y, Zhou L, Liu Q (Dec 2015). "Close and Allosteric Opening of the Polypeptide-Binding Site in a Human Hsp70 Chaperone BiP". Structure. 23 (12): 2191–203. doi:10.1016/j.str.2015.10.012. PMC 4680848. PMID 26655470.
- Fairbrother WJ, Champe MA, Christinger HW, Keyt BA, Starovasnik MA (Oct 1997). "1H, 13C, and 15N backbone assignment and secondary structure of the receptor-binding domain of vascular endothelial growth factor". Protein Science. 6 (10): 2250–60. doi:10.1002/pro.5560061020. PMC 2143562. PMID 9336848.
- Mayer MP, Bukau B (Mar 2005). "Hsp70 chaperones: cellular functions and molecular mechanism". Cellular and Molecular Life Sciences. 62 (6): 670–84. doi:10.1007/s00018-004-4464-6. PMC 2773841. PMID 15770419.
- Wisniewska M, Karlberg T, Lehtiö L, Johansson I, Kotenyova T, Moche M, Schüler H (2010-01-01). "Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78". PLOS ONE. 5 (1): e8625. doi:10.1371/journal.pone.0008625. PMC 2803158. PMID 20072699.
- Zhuravleva A, Gierasch LM (Jun 2015). "Substrate-binding domain conformational dynamics mediate Hsp70 allostery". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112 (22): E2865–73. doi:10.1073/pnas.1506692112. PMC 4460500. PMID 26038563.
- Leu JI, Zhang P, Murphy ME, Marmorstein R, George DL (Nov 2014). "Structural basis for the inhibition of HSP70 and DnaK chaperones by small-molecule targeting of a C-terminal allosteric pocket". ACS Chemical Biology. 9 (11): 2508–16. doi:10.1021/cb500236y. PMC 4241170. PMID 25148104.
- Liebscher M, Roujeinikova A (Mar 2009). "Allosteric coupling between the lid and interdomain linker in DnaK revealed by inhibitor binding studies". Journal of Bacteriology. 191 (5): 1456–62. doi:10.1128/JB.01131-08. PMC 2648196. PMID 19103929.